予果生物:深耕mNGS 實(shí)現(xiàn)感染性疾病的精準(zhǔn)診斷
從醫(yī)生手里的聽診器,到X光檢查技術(shù),再到基因檢測(cè)、宏基因組測(cè)序……隨著技術(shù)的發(fā)展,病原診斷的效率和靈敏度逐漸提升。
予果生物科技(北京)有限公司創(chuàng)始人&CEO夏涵在接受采訪時(shí)表示,“如果把傳統(tǒng)針對(duì)特定病原的檢測(cè)看成是‘釣魚’,那么宏基因組二代測(cè)序技術(shù)(mNGS)就類似于‘大面積撒網(wǎng)捕撈’。mNGS通過(guò)對(duì)臨床樣本中直接提取的DNA和/或RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,再經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)與生物信息學(xué)分析,可一次性完成細(xì)菌、真菌、病毒和寄生蟲等多種病原體檢測(cè),實(shí)現(xiàn)感染性疾病的精準(zhǔn)診斷。”
今年9月份,予果生物憑借病原微生物高通量基因檢測(cè)方案從全球84個(gè)國(guó)家和地區(qū)的4018個(gè)項(xiàng)目中脫穎而出,榮獲HICOOL 2021全球創(chuàng)業(yè)大賽一等獎(jiǎng)。HICOOL全球創(chuàng)業(yè)大賽是以海內(nèi)外人才創(chuàng)業(yè)大賽為主體的綜合性國(guó)際人才活動(dòng),大賽打通并建立了海外人才和本土人才來(lái)京創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)的雙流通道,今年共有來(lái)自84個(gè)不同國(guó)家的5077名創(chuàng)業(yè)者報(bào)名參賽,分布在人工智能/金融科技、醫(yī)藥健康、新一代信息技術(shù)、新能源/新材料/節(jié)能環(huán)保、文化創(chuàng)意、高端裝備等六大賽道。同時(shí),HICOOL圍繞創(chuàng)業(yè)項(xiàng)目“發(fā)掘-落地-孵化-融資-轉(zhuǎn)化”的普遍生命周期,自2020年起就著力構(gòu)建大賽/峰會(huì)、產(chǎn)業(yè)園、管家、基金、在線平臺(tái)、商學(xué)院“六位一體”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)生態(tài)平臺(tái),在海外創(chuàng)業(yè)圈、投資人之間形成了廣泛影響力。
2014年全球病原診斷行業(yè)發(fā)生了一件劃時(shí)代的事件,美國(guó)UCSF團(tuán)隊(duì)使用mNGS,對(duì)一位反復(fù)發(fā)燒患者的體液樣本進(jìn)行基因測(cè)序并找到了感染病因,幫醫(yī)生用最常規(guī)的青霉素治愈了這位幾乎病危的患者。
“在這件劃時(shí)代的事件之后,我們團(tuán)隊(duì)就在思考既然mNGS用于病原感染診斷的優(yōu)勢(shì)相當(dāng)明顯,如何將宏基因組測(cè)序方法更好地標(biāo)準(zhǔn)化,最終應(yīng)用在市場(chǎng)廣闊的病原診斷領(lǐng)域”,夏涵說(shuō)到。2017年夏涵帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)創(chuàng)立了予果生物,成為國(guó)內(nèi)最早深耕mNGS的企業(yè)之一。
據(jù)了解,予果生物是國(guó)內(nèi)最早將游離核苷酸(cell-free)宏基因組高通量測(cè)序技術(shù)(mNGS)轉(zhuǎn)化于臨床的的企業(yè)。其自主研發(fā)的PACEseq超高維度機(jī)器學(xué)習(xí)模型,能實(shí)現(xiàn)對(duì)表型缺乏特異性、病因不明的患者的鑒別,也可以對(duì)不同來(lái)源的微生物進(jìn)行過(guò)濾和判斷,讓病原診斷變得更簡(jiǎn)單,是當(dāng)下最具創(chuàng)新的數(shù)字化解決方案。
當(dāng)人工智能、傳感技術(shù)、云計(jì)算與大數(shù)據(jù)等技術(shù)融入醫(yī)療行業(yè),病原診斷方式也發(fā)生了升級(jí)改變,數(shù)字化的診斷方式可以快速鑒別出致病病原體,輔助醫(yī)生和患者快速明確感染病因,并對(duì)癥進(jìn)行治療。
夏涵表示,“我們認(rèn)為下一代的疾病診斷或者未來(lái)的疾病診斷應(yīng)該是基于數(shù)字化,因?yàn)槲覀冊(cè)谠瓉?lái)的模擬信號(hào)的時(shí)代已經(jīng)停留太長(zhǎng)的時(shí)間了。”
夏涵指出,相比于傳統(tǒng)診斷模式,數(shù)字化診斷最大的差別就是獲得的數(shù)據(jù)量的大小。“宏基因組測(cè)序方法不做預(yù)先假設(shè),一次檢測(cè)結(jié)果通過(guò)與含有2萬(wàn)多種病原的數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比就可以獲得大量的數(shù)據(jù),大量的數(shù)據(jù)依托先進(jìn)的算法和AI技術(shù),可以從海量微生物數(shù)據(jù)中提取并判斷病原微生物,進(jìn)而創(chuàng)造出一種全新的病原診斷模式。”他說(shuō)到。
近年來(lái),第二代基因測(cè)序技術(shù)(NGS)引領(lǐng)行業(yè)快速發(fā)展,并且由于其擁有高通量、低成本、測(cè)序時(shí)間短等諸多優(yōu)勢(shì),至今NGS在全球測(cè)序市場(chǎng)中仍占據(jù)主導(dǎo)地位。
夏涵表示,“在實(shí)際臨床應(yīng)用中,宏基因組測(cè)序檢測(cè)的大量樣本中發(fā)現(xiàn)有些病原是常見的,有些病原是罕見的,但是正因?yàn)楹昊蚪M測(cè)序可檢測(cè)出這些常規(guī)方法無(wú)法檢出的病原,醫(yī)生可參考宏基因組測(cè)序檢測(cè)結(jié)果并結(jié)合臨床表現(xiàn)對(duì)癥下藥,精準(zhǔn)治療,使患者早日康復(fù)。”
隨著技術(shù)的進(jìn)步,基因測(cè)序市場(chǎng)發(fā)展迅速。根據(jù)NGS(新一代基因測(cè)序)行業(yè)峰會(huì)數(shù)據(jù),我國(guó)基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)正步入快車道,2018年全球基因測(cè)序市場(chǎng)規(guī)模達(dá)到102.0億美元,其中中國(guó)基因測(cè)序市場(chǎng)規(guī)模達(dá)到92.0億元人民幣,約占全球市場(chǎng)份額的9%-10%。去年我國(guó)基因檢測(cè)企業(yè)在一級(jí)市場(chǎng)中所獲融資達(dá)到193億元,相比2019年融資量,年增長(zhǎng)率達(dá)153%。
近年來(lái),基因測(cè)序行業(yè)的迅速發(fā)展,吸引了大量資本和企業(yè)的涌入。截止2021年中予果生物已經(jīng)累計(jì)完成5.2億元融資,是mNGS賽道融資體量最大的公司,投資人囊括北極光創(chuàng)投,龍磐資本、辰德資本、創(chuàng)新工場(chǎng)、LYFE等該領(lǐng)域最知名機(jī)構(gòu)。
夏涵認(rèn)為,“資本的進(jìn)入加速了市場(chǎng)的發(fā)展,競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的布局也讓mNGS領(lǐng)域變得熱鬧起來(lái)。但不管市場(chǎng)是低迷還是熱鬧,予果會(huì)一直堅(jiān)守‘讓病原診斷更簡(jiǎn)單’這個(gè)初心使命,踏踏實(shí)實(shí)去做創(chuàng)新。”
將初心化為動(dòng)力,從72小時(shí),到48小時(shí),再到9小時(shí)……4年多來(lái),予果生物在病原精準(zhǔn)診斷的速度上一再取得突破。從全國(guó)各醫(yī)院送來(lái)的檢測(cè)樣本,已經(jīng)可以實(shí)現(xiàn)當(dāng)天晚上11點(diǎn)前上機(jī)測(cè)試,讓醫(yī)生第二天一早便能根據(jù)檢測(cè)結(jié)果制定治療方案。
前不久,予果生物發(fā)布了全新病原檢測(cè)產(chǎn)品BloodSeq,檢測(cè)性能遠(yuǎn)比市場(chǎng)常見產(chǎn)品更快速、更靈敏、更精準(zhǔn)。該產(chǎn)品一經(jīng)推出,受到了臨床醫(yī)生的一致好評(píng)。
“我們希望幫助更多的醫(yī)生進(jìn)行快速精準(zhǔn)的治療。”夏涵說(shuō)到。現(xiàn)在,予果生物自主研發(fā)的病原數(shù)字化檢測(cè)方案已經(jīng)在全國(guó)31個(gè)省份,150多個(gè)中心城市開展業(yè)務(wù),累計(jì)服務(wù)超1000家臨床醫(yī)院、2000個(gè)臨床科室,累計(jì)檢測(cè)樣本量近10萬(wàn)例,樣本總數(shù)位居全球前列,其中腦脊液檢測(cè)量位列全球第一,且增長(zhǎng)速度非???。
夏涵稱,予果生物今年研發(fā)投入大約有7000萬(wàn),明年還會(huì)繼續(xù)加大投入,預(yù)測(cè)到2024年之前研發(fā)投入占比都不會(huì)低于30%。予果生物目前能將生信分析和mNGS有效結(jié)合,形成較高的技術(shù)和數(shù)據(jù)壁壘。公司未來(lái)一段時(shí)間仍會(huì)專注于研發(fā),做好產(chǎn)品的升級(jí),推動(dòng)以測(cè)序技術(shù)做病原診斷市場(chǎng)的發(fā)展。
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